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・ハイパーバイザーのデメリットは何でしょうか？

この記事が仮想化のタイプの違いに関して詳細に説明しています。
http://securitywing.com/types-virtualization-technology/

一般に製品などの環境で用いられる仮想化技術はタイプ1です。（このタイプを弊社オフィスでも採用しています。）
このタイプが仮想化技術の中ではオススメです。

もう一つのバージョンがこのプログラムでも利用しているVirtualBoxとVMWareで利用されている技術です。
この技術はハードディスク上でなく、WindowsやMac OSの最上層で動きます。リソース不足のためにクラッシュするなど、非常に多くのデメリットがあります。